微生物群落是指生活在人类或动物体内的所有细菌、真菌、寄生虫和病毒。这些微生物大部分存在于肠道内，大部分是有帮助的，刺激免疫系统，分解食物，帮助合成关键维生素。
在健康的身体里，病原生物和有益生物是平衡的。然而，如果使用抗生素、疾病或不健康的饮食扰乱了平衡，身体可能会容易生病。
成人肠道菌群的特点是它以稳定的状态存在，这需要一个主要的干扰来永久地改变这种状态。
在这项研究中，小鼠被分为四组。经过三周的节食，所有的老鼠都恢复了标准的饮食，没有运动(http://www.maoyihang.com/sell/l_35/)，这是实验室饲养老鼠的常用方法。在14周时，研究小组检查了动物体内细菌的多样性和丰富度。
发现西方饮食组肠道细菌(如苏云金杆菌)数量明显减少。这种细菌参与碳水化合物代谢。研究分析还表明，小鼠肠道细菌对运动量敏感。但无论是否运动，饲喂标准日粮的小鼠体内小鼠杆菌数量增加，而饲喂高脂日粮的小鼠体内小鼠杆菌数量减少。这种细菌及其细菌家族可能会影响其宿主可用的能量。对这些细菌可能具有的其他功能的研究仍在继续。
另一个值得注意的效果是，经过5周的跑步机训练，一种与苏云金芽孢杆菌高度相似的细菌增加了，这表明单独运动可能会增加这种细菌的存在。
本研究发现早期西方饮食对微生物群落的影响比早期运动更持久。
