在这项研究中,研究人员从107 名晚期癌症患者中生成了214 个癌症类器官,总体成功率为75.7%(162/214),其中212 个为肺癌类器官(LCO),主要来源于恶性浆液性渗出液(MSE)。
为了检验恶性浆液性渗出液和恶性浆液性渗出液来源的肺癌类器官基因组图谱的一致性,研究人员对25名患者进行了二代测序,并对渗出液和肺癌类器官样本进行了检测,如图所示进行了体细胞突变分析以下。这些数据显示肺癌类器官样本的变异敏感性为70.5% (93/132),阳性预测值为69.4% (93/134)。
此外,基于肺癌类器官的肿瘤突变率(TMB) 与基于积液的肿瘤突变率(TMB) 呈正相关(Pearson r=0.68,p=0.02,图E),表明积液样本和肺癌细胞器之间存在基因组特征。 细胞器可能反映其同源组织的遗传背景。
研究人员将来自36 名具有相同临床方案和LCO-DST 结果的患者的肺癌类器官分为四组:奥希替尼组、化疗组、双靶向治疗组和其他靶向治疗组。接受者性能分析(ROC) 用于确定LCO-DST 区分临床敏感和耐药患者的能力。 LCO-DST 的总体敏感性为84.0%,特异性为82.8%,准确性为83.3%。这些结果表明,肺癌类器官可以预测未治疗和治疗患者对靶向治疗的临床反应。
为了检验肿瘤类器官对药物反应的实验稳定性和异质性,研究人员证实在同一患者的不同采样时间获得的肿瘤类器官基因组图谱高度一致,并测试了组织样本、液体样本和肿瘤细胞器。基因组图谱的一致性。
本研究纳入了两名患有晚期肺腺癌双靶基因突变的患者:#60 号患者被诊断为IVB 期肺腺癌,基线时在CSF 中检测到EGFR L858R 突变和MET (5.0) 拷贝数增加。 #61 号患者被诊断为IVA 期肺腺癌,基线时可检测到EGFR 19del。
与单一靶向药物相比,两例患者的LCO-DST结果均显示靶向联合治疗(奥希替尼+ sirotinib/卡博替尼)的肿瘤控制效果更好,临床证实双-靶向联合治疗实现了部分缓解(PR)。这些案例表明,LCO-DST 是联合方案有效性的良好指标。
为了研究EGFR 和RET 抑制剂联合治疗的潜在分子机制,研究人员进行了无标记高通量4D 蛋白质组学分析。主成分分析(PCA)结果表明,不同治疗组具有不同的表达水平,即不同的治疗效果。三个处理组均表现出相同的蛋白表达趋势,核蛋白的变化数量最多,其次是细胞质和膜蛋白。所有三种治疗的蛋白质表达变化已被证明主要调节核功能,包括基因表达。
基于这些分析可以看出,药物敏感性与临床反应的总体一致性可高达83.33%,LCO-DST在预测晚期癌症治疗反应方面具有非常高的准确性,在精准医疗方面具有巨大潜力。大规模临床试验以确定各种疗法的精确阈值。
个性化抗癌药物离不开人们对基因突变的认识,药物疗效离不开准确的药敏检测。癌症治疗极其复杂,但科学家们不断开发新技术,以制定更有效的治疗策略。