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一种新图谱或能为研究人员识别癌症发生的深层机制提供一种新方法

放大字体  缩小字体发布日期:2023-07-14 09:18  浏览次数:38
摘 要:最近,发表在国际杂志Nature Metabolism上,来自威尔-康奈尔医学院等机构的科学家们通过研究开发了一种图谱,该图谱编目了肿瘤
  最近,发表在国际杂志Nature metabolism上,来自威尔-康奈尔医学院等机构的科学家们通过研究开发了一种图谱,该图谱编目了肿瘤样本中称之为代谢产物的小分子的基因活性和水平,其或能为研究人员识别癌症发生的深层机制提供一种新方法。
 
  结合新的数据集和现有的代谢产物和基因活性数据集,研究人员创建了癌症代谢图谱(camp, cancer atlas of metabolic profiles)。这张地图包含了11种不同癌症类型的988种肿瘤和正常组织的对比数据,通过分析这些数据,揭示了两个主要遗传和代谢产物之间的关系,并揭示了其他癌症的发生机制。新的地图将有助于科学家们形成对肿瘤如何运作的核心理解。
 
  研究者ed reznik博士表示:“我们的事业代谢产物和基因表达水平的变化,如何协调起来的基本问题,我们提供的答案,是美好的,通过这种微妙和谐基因编码的酶及其代谢产物气质分子作用即肿瘤微环境大使免疫细胞变为独特的存在出现。代谢产物是在身体组织和血液中的代谢过程中使用或生成的小有机分子,通常在生化反应中起作用,赋予细胞能量或作为蛋白质、糖类、脂质、dna和rna的基本组成部分。组织内代谢产物的水平模式是生物学中重要的信息层之一。“

  目前研究人员已经知道,癌症中的关键事件(如肿瘤的发生和抗药性的获得)都伴随着代谢产物的显著变化。这种癌症相关的代谢变化与基因活性的变化联系在一起,是科学家们为什么发生这种代谢产物的变化,有些酶或其他蛋白质引导这种变化,以及他有些场合破坏这种机制是防止癌症能否有助于理解可以帮助您。
 
  camp database数据库是针对原发性肿瘤样本代谢产物和基因活性水平的最大单一数据集,其组合可能会给科学家带来很大的挑战,因此开发了这种分析。研究者krumsiek " rna碱基序列等的研究方法相比,代谢产物研究中所使用的方法的标准化程度要低得多,一般情况下两种癌症代谢产物研究测定不会代谢产物,甚至同一组两研究中测量的代谢产物有时能在数据集中有名称的差异。
 
  目前,科学家们正致力于整理各数据集的不同特征。通过寻找数据集中所有癌症类型中最明显的基因-代谢产物之间的关系,可以揭示更广泛的癌症发生机制。研究者发现的一种模式是,与加密酶和其他蛋白质的基因密切相关的代谢物在代谢物的生成和调节中起着重要的作用。查明调节癌症相关代谢产物水平的遗传基因,将有助于今后对这些代谢产物在引发癌症方面起到重要作用的进一步调查。
 
  在另一个显著的模型中,一些代谢物系列的基因与活性化有密切的关系,基因与代谢物的生产和加工过程有明确的关系。通过对其中参与的基因进行详细的研究,研究者们意识,这种类型可能反映了免疫细胞的存在,这些免疫系统可以渗透到实体肿瘤。克拉姆西克博士说:“免疫细胞似乎在大范围内影响肿瘤样本的代谢产物特征。”这种研究结果的肿瘤样本中多种细胞类型的贡献度强调理解的重要性,为此,研究者们肿瘤样本的正确位置帮你基因活性代谢产物地图化计划着尖端技术的转型。
 
  本文的研究结果表明,在细胞异质组织中,基因-代谢产物的共变部分可能来自基因和代谢产物的相互作用。
 
 
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