最近，国际权威期刊《Cell》上发表了一项题为“Pan-cancer proteogenomics expands the landscape of therapeutic targets”的突破性研究成果。该研究由贝勒医学院等机构的科学家共同完成，他们通过整合多种组学数据，成功揭示了多种癌症类型中潜在的全新治疗靶点，为癌症治疗领域带来了新的希望。
研究人员采用了一种前所未有的综合性方法，融合了来自10种不同癌症类型的蛋白质组学、基因组学和表观遗传组学数据。通过对这些海量数据的深入分析，他们在癌症组织中精准地识别出了一系列特殊蛋白质和小型蛋白（肽类）靶点。进一步的实验验证表明，这些靶点中的许多都具有成为有效治疗策略的潜力。
据该研究的主要负责人Bing Zhang教授介绍，靶向性治疗因其针对癌细胞中特定蛋白的特性，相较于传统的放疗和化疗，往往能取得更为显著的临床治疗效果。然而，目前FDA批准的癌症药物所针对的蛋白靶点仍不足200种，远远不能满足临床需求。而此次研究通过对10种癌症类型的1000多种组织样本进行深入分析，有望极大地扩展潜在治疗靶点的范围。
为了实现这一目标，研究人员充分利用了计算工具(http://www.maoyihang.com/sell/l_5/)，对蛋白质基因组学数据进行了全面整合。这些数据涵盖了DNA、RNA和蛋白质的全基因组信息，由临床蛋白质组肿瘤分析联盟（CPTAC）从前瞻性收集的未经治疗的原发性肿瘤样本中精心获取，并与匹配的正常邻近组织进行了深入比较。通过将CPTAC数据集与其他公共数据集相结合，研究人员成功揭示了多种肿瘤类型中基因和蛋白质改变的共性与差异，为新型治疗靶点的发现提供了重要线索。
研究团队不仅致力于理解已知药物靶点的特性，还积极寻找新的靶点以助力新型药物的开发。他们发现，某些在癌症组织中过量表达或过度活跃的蛋白质在正常组织中并不常见，而肿瘤抑制基因的缺失则可能导致对其他蛋白质的依赖，从而成为潜在的治疗靶点。此外，研究人员还探索了肿瘤抗原（包括新抗原）的潜力，这些由肿瘤基因突变衍生的癌症特异性肽类可能为免疫治疗提供新的方向。
尤为引人注目的是，研究人员还意外发现了一种抗真菌药物在减少多种癌症类型生长方面的潜力，这进一步激发了他们探索现有药物新用途的兴趣。同时，他们还识别出了一些目前尚无针对性药物的潜在蛋白靶点，如激酶和细胞表面蛋白等，这些发现为新型药物的研发提供了宝贵的机会。
为了验证这些潜在治疗靶点的有效性，研究人员在实验室培养的细胞和动物模型中进行了大量实验。结果显示，这些靶点不仅在癌症研究中展现出重要价值，还具备作为潜在治疗性靶点的巨大潜力。
