近日，一项由柏林大学夏瑞蒂医学院等机构的研究人员完成的研究成果发表在国际杂志《Gut Microbes》上，题为“Segmental patterning of microbiota and immune cells in the murine intestinal tract”。该研究揭示了小鼠胃肠道不同解剖部位携带独特的微生物群落，并且这些微生物群落的构成会对特定区域的免疫细胞类型和数量产生影响。
在研究过程中，科学家们将小鼠的肠道组织分割成多个部分，并提取微生物DNA以进行分析，以此来对比无菌小鼠与常规定植小鼠胃肠道特性的差异。他们采用宏基因组测序技术鉴定出所有存在的细菌种类，并且从组织片段中分离免疫细胞，运用流式细胞术进行分析。流式细胞术是一种基于特定细胞标记物来识别和量化不同免疫细胞类型的先进技术。
研究结果表明，普通小鼠胃肠道内的微生物群落在不同位置上存在差异，这直接影响了肠道内免疫细胞的分布情况。例如，在肠道远端，适应性免疫细胞（如T细胞和B细胞）在接触抗原后变得更加活跃，而在肠道近端，先天性免疫细胞（如巨噬细胞和自然杀伤细胞）更为丰富。无菌小鼠由于缺乏细菌抗原，其肠道中的这种免疫细胞分布模式受到了干扰。
研究者进一步对免疫细胞进行了分类，确定它们的存在和丰度是由位置决定的，还是由微生物群落影响，抑或是两者兼而有之。为了便于其他研究人员使用这些数据，他们开发了一个应用程序，允许用户查询特定免疫细胞类型，并查看它们在肠道中最为丰富的区域，以及这些细胞是否受到微生物组、位置或两者交互作用的影响。
这项工作突显了肠道中免疫细胞与微生物组构成的空间异质性，并确定了那些容易受到微生物影响的免疫细胞亚群。这些发现为理解在疾病模型中免疫细胞变化提供了新视角，并可能帮助科学家们探索这些变化如何影响疾病的进程。此外，该数据库资源也为未来的研究提供了一个宝贵的工具(http://www.maoyihang.com/sell/l_5/)，使得研究者们能够更好地了解免疫细胞在不同疾病状态下的行为。
