### 实时可编程转录组测序技术PROFIT(http://www.maoyihang.com/sell/l_25/)-seq：实现目标转录本的单分子精确检测与全转录组无偏定量
近日，中国科学院动物研究所赵方庆团队在《自然-细胞生物学》（*Nature Cell Biology*）上发表了一篇题为《实时可编程转录组测序（PROFIT-seq）》的研究论文。该团队开发了一种全转录组可编程智能测序新技术——PROFIT-seq（Programmable Real-time Omics for Full-length Transcriptome Sequencing）。该技术首次将全转录组捕获技术与计算机编程实时操控算法相结合，能够在测序过程中同时进行分析和富集，实现目标转录本的单分子精确检测和全转录组的无偏定量。
#### 技术特点
1. **全转录组捕获**：
- PROFIT-seq能够捕获多种类型的转录本，包括多聚腺苷酸化、非多聚腺苷酸化和环状RNA等。
- 通过创新的复合逆转录策略和滚环扩增技术，PROFIT-seq能够在测序过程中实时控制，根据需要选择性地富集目标转录本。
2. **实时控制与富集**：
- 该技术能够在测序过程中实时判断测序分子来源，并可编程选择目标测序分子进行全长测序。
- 仅需提供目标转录本的参考序列，即可灵活实现测序的实时操控，满足多种类型转录本的同步检测需求。
3. **智能定量模型**：
- 基于最大期望算法的全转录组智能定量模型，结合目标转录本的全长序列和其他非目标分子的短时测序标签，实现了精准的全转录组定量分析。
- 与传统方法相比，PROFIT-seq大幅提高了样本中目标转录本的检测效率和测序通量。
4. **高效、精准的单分子检测**：
- 通过滚环扩增技术，结合cDNA的多轮通读与纳米孔测序错误校正，实现了目标转录本的高效、精准的单分子检测。
#### 应用前景
1. **生命科学研究**：
- PROFIT-seq可广泛应用于基因表达调控、非编码RNA功能研究、环形RNA鉴定等领域，为生命科学研究提供强大的工具(http://www.maoyihang.com/sell/l_5/)。
2. **病原体检测**：
- 在临床检测中，PROFIT-seq通过实时富集痰液样本中肺炎相关病原，大幅提高了病原体的检测通量（3-5倍），并缩短了关键突变的鉴定时间（减少75%时间），实现了快速、准确的目的病原鉴定。
3. **临床诊断**：
- 该技术还有效检测了结直肠癌相关微生物与宿主免疫系统的复杂互作，揭示了在结直肠息肉恶性瘤变过程中，宿主免疫组库与肠道微生物的相互作用规律，为疾病的早期诊断和治疗提供了新的思路。
#### 结论
PROFIT-seq技术首次提出了转录组智能测序的概念，依托人工智能纳米孔自适应测序算法，能够在测序过程中实时判断测序分子来源，并可编程选择目标测序分子进行全长测序。这一创新技术无需复杂的前期实验处理，仅需提供目标转录本的参考序列，即可灵活实现测序的实时操控，满足多种类型转录本的同步检测需求。PROFIT-seq的开发不仅为转录组研究带来了新的突破，也为未来的临床应用提供了广阔的可能性。未来，随着技术的进一步优化和推广，PROFIT-seq有望在更多领域发挥重要作用，推动生命科学和医学研究的发展。
