近日，耶鲁大学的研究人员在《Cell》期刊上发表了一项重要研究，介绍了一种新型的病理学工具(http://www.maoyihang.com/sell/l_5/)——Patho-DBIT(http://www.maoyihang.com/sell/l_25/)（pathology-compatible deterministic barcoding in tissue，组织中与病理学兼容的确定性条形码）。这项技术利用DNA条形码绘制RNA和蛋白的空间关系图，对RNA进行全面探究，有望在癌症诊断和治疗中发挥重要作用。
研究背景
传统的病理学方法在处理福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织样本时，难以提供详细的分子信息，尤其是在空间分辨率方面。这限制了对肿瘤生物学的深入理解，进而影响了诊断和治疗的精准性。
研究方法
Patho-DBiT技术通过以下步骤实现对RNA和蛋白的空间关系图的绘制：
1. **DNA条形码**：利用DNA条形码标记组织中的RNA分子。
2. **微流体设备(http://www.maoyihang.com/sell/l_4/)**：使用微流体设备从两个方向将条形码送入组织，形成独特的二维像素“马赛克”。
3. **空间信息**：提供详细的RNA和蛋白的空间分布信息，从而能够更全面地了解肿瘤的分子特征。
主要发现
1. **全面的RNA探究**：Patho-DBiT能够全面探究组织中的RNA分子，包括那些在癌症中具有调控作用的非编码RNA。
2. **空间分辨率**：提供高分辨率的空间信息，有助于理解RNA分子在组织中的具体位置和功能。
3. **临床应用**：这项技术能够直接“看到”临床组织样本中的所有RNA类型，它们的位置和功能，为创建针对患者的靶向疗法提供依据。
临床意义
1. **更精确的诊断**：Patho-DBiT能够提供更详细的分子信息，帮助医生进行更精确的癌症诊断。
2. **靶向治疗**：通过对RNA和蛋白的空间关系图的详细了解，可以开发更有效的靶向疗法。
3. **转化研究**：帮助研究人员理解低级别肿瘤向更具侵袭性肿瘤转化的机制，从而找到预防方法。
未来展望
论文共同通讯(http://www.maoyihang.com/sell/l_25/)作者Mina Xu博士表示，这种深入的分子研究将极大地促进对肿瘤生物学的理解，为提供更精确、更可行的诊断创造条件。Rong Fan博士则认为，Patho-DBiT将彻底改变未来研究人类生物学的方式，特别是在理解RNA分子的复杂生物学特性方面。
论文共同第一作者Zhiliang Bai博士指出，这项技术特别适用于已存档多年的FFPE组织样本，这些样本中包含大量高度碎片化的RNA分子，传统方法无法捕捉到它们的所有重要信息。Jun Lu博士补充说，Patho-DBiT-seq还能生成非编码RNA表达的空间图谱，这对于理解非编码RNA在生物学和疾病中的作用具有重要意义。
总之，Patho-DBiT技术为癌症诊断和治疗提供了新的工具，有望在未来的临床实践中发挥重要作用。尽管还需要更多的研究来测试和验证其在患者样本中的应用，但这项技术的潜力已经引起了广泛关注。
